Они ничем не отличаются. Три серии делают потому что не у всех вырабатываются антитела после одной серии. Допустим после первой прививки антитела вырабатываются у 80% младенцев, после двух прививок - у 95%, а после трех - у 98%. Вот и всем колют три дозы. Чтобы наверняка. Ну или почти наверняка.
Поэтому единственное последствие отказа от последующих серий - это что антитела возможно не выработались, и первая серия была бесполезна. Это, в принципе, можно проверить сдав анализ на антитела, если это важно.