В данном случае это за все время существования VAERS, т.е. где-то с 1986-го.
Здесь, например, с 2000 года (там можно подставить другие года).

Проценты считаются от всех зарегистрированных случаев побочных эффектов.
То есть например в первой строчке сообщается, что всего в VAERS было зарегистрировано 268 случаев смерти детей младше 3-х лет после вакцин от кори, и это составляет 0.3% всех побочных случаев от этих вакцин.